外用ミノキシジルは頭皮に直接塗布するタイプのミノキシジル製剤です。日本では1%・5%の濃度の製品が市販されており（リアップなど）、5%製品は男性用として承認されています。
1日1〜2回の塗布が一般的で、継続使用が重要とされています。効果が現れるまでには通常3〜6ヶ月程度かかるとされており、使用中止後は効果が消失することがあります。
副作用として塗布部位の発赤・かゆみ・フケ増加・多毛（顔面への垂れによる）などが報告されています。内服と比較すると全身への影響は小さいとされていますが、個人差があります。