保険適用とは、健康保険（国民健康保険・社会保険等）の給付対象として認められた医療行為・医薬品・医療材料を指します。保険適用の医薬品・診療は、厚生労働省が審査・承認し薬価・診療報酬として収載されます。
GLP-1受容体作動薬のうち、オゼンピック・ビクトーザは2型糖尿病治療薬として保険適用されています。ウゴービは2024年より一定の条件を満たした肥満症患者に対して保険適用となっています（BMI35以上、またはBMI27以上で2型糖尿病等の合併症）。
保険適用条件を満たさない使用（例：適応外の体重管理目的）は自費診療となります。保険診療と自費診療を同一医療機関で混在させる「混合診療」は原則禁止されているため、保険適用外の使用を希望する場合は自費専門のクリニックを選択する必要があります。